تم إحداث مؤسسة الأمانة العامة لحزب الاستقلال بعد وفاة المغفور له الزعيم علال الفاسي سنة 1974 رحمه الله؛ بحيث أقر المؤتمر التاسع بالإجماع أن زعيم التحرير، ورائد الحركة الوطنية المغربية، ومؤسس حزب الاستقلال، سيحتفظ بصفة الرئيس الدائم نظرا للخدمات الجليلة التي أسداها للحزب والوطن.
ينتخب الأمين العام، بمقتضى الفصل 57 من قوانين حزب الاستقلال، من المجلس الوطني بالاقتراع السري وبأغلبية الأصوات لمدة أربع سنوات قابلة للتجديد مرة واحدة.
ويجوز للأمين العام، بصفة استثنائية، في حالة ما إذا كان يتولى مسؤولية الوزارة الأولى أن يترشح لولاية جديدة.
وتتولى مؤسسة الأمانة العامة رئاسة اجتماعات اللجنة المركزية، ومداولات اللجنة التنفيذية، والدورات الاستثنائية للمؤتمر العام. وهذا فضلا عن مسؤوليتها عن تمثيل الحزب والنيابة عنه، والسهر على هويته الإيديولوجية باحترام مبادئه وأهدافه الثابتة، وكذا الالتزام بتنفيذ مقرراته( الفصل 58).
الأمين العام الحالي لحزب الاستقلال هو الأخ عباس الفاسي الذي تم انتخابه للمرة الثالته خلال المؤتمر 15 المنعقد في 9/10/11يناير 2009.
